Hi-C （Chromosome conformation capture followed by high-throughput sequencing）技术的原理是，利用甲醛交联固定细胞核内染色质的三维结构，将DNA进行酶切和原位重新连接，此时DNA片段的相互作用几率便可反映其在三维空间上的相对距离。通过对全基因组DNA远距离相互作用进行捕获，结合高通量测序技术及生物信息分析，最终可获得染色质DNA在空间的相对位置信息，并通过模型构建最终获得染色质在细胞核内的三维结构。