介绍:RRBS,(Reduced Representation Bisulfite Sequencing),简化基因组DNA甲基化测序,通过限制性内切酶对基因组进行酶切,富集启动子及CpG岛区域,通过亚硫酸氢盐(Bisulfite)处理将未甲基化的胞嘧啶(C)转化为尿嘧啶(U),最后进行PCR扩增和测序用较小的数据量得到包含最多CpG位点甲基化信息的单碱基精度的甲基化图谱。
1.用于研究细胞分化和发育过程中DNA甲基化变化,特别是在基因启动子区域和CpG岛上的变化; 2.用于鉴定发生生物学变化(如癌变)前后甲基化差异以及其介导的基因表达变化; 3.评估特殊处理后(如药物)对甲基化的影响,了解其对特定基因区域的甲基化状态产生的影响。
1.精确度高:在其覆盖范围内可达到单碱基分辨率; 2.重复性好:多样本的覆盖区域重复性可达到85%-95%,适用于多样本间的差异分析; 3.性价比高:测序区域针对高CpG区域,数据利用率更高。